Python II y GitHub

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# Python II y GitHub
### Licenciatura en Ciencias Genómicas,UNAM
### First version: yyy-mm-dd; Last update: 2022-03-10

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## Objetivo
Conocer generalidades del lenguaje python.

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## Contenido de la unidad

1. Historia
2. Versiones de Python
3. Ecosistemas

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# Historia

.full-width[.content-box-blue[Creador de Python: **Guido van Rossum**]]

.pull-left[

.tiny[[Entrevista](https://www.youtube.com/watch?v=J0Aq44Pze-w)]

]

.pull-right[

- Originario de los Paises Bajos

- Titulo: Matemáticas y computación

- Investigador del Centrum Wiskunde & Informatics (CWI)

]

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## Ideas de Python

Python fue creado para ser:

.full-width[.content-box-red[Busca tener: **Legibilidad**]]

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## ¿Qué es python?

- Lenguaje de programación interpretado

- Sintaxis de código legible

- Lenguaje de programación multiparadigma

.tiny[
[Mas información](https://www.python.org/about/gettingstarted)
]

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## Versiones de python

Python tuvo su primera verisión al público en 1991, y a continuado versionando de forma similar.

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## Python ¿2 o 3?

- ¿Qué versión de python nos conviene?

- ¿Porqué?

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## Python ¿2 o 3?

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## Python ¿2 o 3?

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## Instalación

Puedes leer los requisitos en [github](https://github.com/PhillBet/VSCodeConfigForPython) y seguir los pasos para la instalación y configuración de python y vsCode.

En este curso usaremos:

- Python 3

- Visual Studio Code (vsCode)

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## ¿Tienes python?

1. Abre una terminal

2. Escribe `python` o `python3`

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## ¿Qué versión tenemos?

Podemos checar la **versión** y el **PATH** de `python` de distintas maneras:

- Bash:

```bash
python3 --version

which python3
```

```
## Python 3.7.6
## /opt/anaconda3/bin/python3
```

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## ¿Qué versión tenemos?

Podemos checar la **versión** y el **PATH** de `python` de distintas maneras:

- En python:

1. Abre una terminal

2. Escribe `python` o `python3`

Checamos la **versión**

```python
import sys
sys.version
```

```
## '3.7.6 (default, Jan  8 2020, 13:45:03) \n[Clang 4.0.1 (tags/RELEASE_401/final)]'
```

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Checamos el **PATH**

```python
print(sys.path)
```

```
## ['', '/opt/anaconda3/bin', '/opt/anaconda3/lib/python37.zip', '/opt/anaconda3/lib/python3.7', '/opt/anaconda3/lib/python3.7/lib-dynload', '/Users/helysalgado/Dropbox (UNAM-CCG)/PGC_CO/Proyectos/05.Docencia/LCG-Bioinformatica/Programas-Materias-Diseño/my_env/lib/python3.7/site-packages', '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/4.1/Resources/library/reticulate/python', '/Users/helysalgado/Dropbox (UNAM-CCG)/PGC_CO/Proyectos/05.Docencia/LCG-Bioinformatica/Programas-Materias-Diseño/my_env/lib/python37.zip', '/Users/helysalgado/Dropbox (UNAM-CCG)/PGC_CO/Proyectos/05.Docencia/LCG-Bioinformatica/Programas-Materias-Diseño/my_env/lib/python3.7', '/Users/helysalgado/Dropbox (UNAM-CCG)/PGC_CO/Proyectos/05.Docencia/LCG-Bioinformatica/Programas-Materias-Diseño/my_env/lib/python3.7/lib-dynload']
```

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## Ecosistema de Python

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## Anaconda

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## Bioconda

.tiny[
[Grüning, Björn, et al. "Bioconda: sustainable and comprehensive software distribution for the life sciences." Nature methods 15.7 (2018): 475-476.](https://www.nature.com/articles/s41592-018-0046-7)
]

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##  Rosalind

.tiny[
[Pagina web de Rosalind](http://rosalind.info/problems/locations/)
]

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## Bibliografía

- [Python for Biologist](https://pythonforbiologists.com/introduction)
  - [Ejercicios](https://pythonforbiologists.com/exercise-files)

- [Advanced Python for Biologist](file:///Users/user/Documents/Doctorado/Courses/Taught/pythonCCG_2021/References/advanced-python-biologists.pdf)